HAVCR2

HAVCR2
Доступные структуры PDB Поиск ортологов: PDBe RCSB Список идентификаторов PDB 5F71
Идентификаторы
Псевдонимы	HAVCR2, HAVcr-2, KIM-3, TIM3, TIMD-3, TIMD3, Tim-3, CD366, hepatitis A virus cellular receptor 2, SPTCL
Внешние ID	OMIM: 606652 MGI: 2159682 HomoloGene: 129541 GeneCards: HAVCR2
Расположение гена (человек) Хр. 5-я хромосома человека[1] Локус 5q33.3 Начало 157,085,422 bp[1] Конец 157,142,869 bp[1]
Расположение гена (Мышь) Хр. 11-я хромосома мыши[2] Локус 11|11 B1.1 Начало 46,345,762 bp[2] Конец 46,372,082 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК Bgee Человек Мышь (ортолог) Наибольшая экспрессия в C1 segment upper lobe of left lung decidua Наибольшая экспрессия в decidua stroma of bone marrow lumbar subsegment of spinal cord endothelial cell of lymphatic vessel primary visual cortex dentate gyrus of hippocampal formation granule cell Дополнительные справочные данные BioGPS Дополнительные справочные данные
Генная онтология Молекулярная функция связывание с ионом металла связывание с белками плазмы Компонент клетки часть мембраны мембрана межклеточные контакты early endosome Иммунологический синапс поверхность клетки mediator complex Биологический процесс negative regulation of natural killer cell mediated cytotoxicity directed against tumor cell target negative regulation of defense response to bacterium negative regulation of interferon-gamma production negative regulation of immunological synapse formation adaptive immune response maternal process involved in female pregnancy positive regulation of cytokine production negative regulation of natural killer cell activation immune system process negative regulation of immune response to tumor cell negative regulation of interleukin-6 production negative regulation of granulocyte colony-stimulating factor production natural killer cell tolerance induction positive regulation of interferon-gamma production positive regulation of macrophage activation regulation of tolerance induction dependent upon immune response negative regulation of T-helper 1 type immune response positive regulation of defense response to bacterium positive regulation of interleukin-4 production negative regulation of gene expression positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling negative regulation of myeloid dendritic cell activation macrophage activation involved in immune response negative regulation of T cell proliferation positive regulation of T cell proliferation positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade positive regulation of innate immune response negative regulation of interferon-alpha production negative regulation of innate immune response positive regulation of chemokine production negative regulation of T cell activation via T cell receptor contact with antigen bound to MHC molecule on antigen presenting cell negative regulation of tumor necrosis factor production toll-like receptor 9 signaling pathway negative regulation of type I interferon production врождённый иммунитет воспалительная реакция negative regulation of interleukin-3 production negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity toll-like receptor 3 signaling pathway negative regulation of interleukin-2 production cellular response to lipopolysaccharide positive regulation of interleukin-1 production toll-like receptor 7 signaling pathway defense response to Gram-positive bacterium regulation of transcription by RNA polymerase II Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи Вид Человек Мышь Entrez 84868 171285 Ensembl ENSG00000135077 ENSMUSG00000020399 UniProt Q8TDQ0 Q8VIM0 RefSeq (мРНК) NM_032782 NM_134250 RefSeq (белок) NP_116171 NP_599011 Локус (UCSC) Chr 5: 157.09 – 157.14 Mb Chr 11: 46.35 – 46.37 Mb Поиск по PubMed Искать[3] Искать[4]
Информация в Викиданных
Смотреть (человек) Смотреть (мышь)

HAVCR2, или TIM-3 (англ. Hepatitis A virus cellular receptor 2, или T-cell immunoglobulin and mucin domain 3) — мембранный белок, продукт гена HAVCR2.

Белок был впервые описан в 2002 году на поверхности интерферон-гамма-продуцирующих CD4+ Th1 и CD8+ Tc1 клеток^[5][6]. Позже экспрессия HAVCR2 была обнаружена также на клетках Th17^[7], регуляторных T-клетках^[8], а также на дендритных клетках, естественных киллерах, моноцитах^[9].

1. ↑ ^{1 2 3} GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000135077 - Ensembl, May 2017
2. ↑ ^{1 2 3} GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000020399 - Ensembl, May 2017
3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. ↑ Monney L., Sabatos C. A., Gaglia J. L., Ryu A., Waldner H., Chernova T., Manning S., Greenfield E. A., Coyle A. J., Sobel R. A., Freeman G. J., Kuchroo V. K. Th1-specific cell surface protein Tim-3 regulates macrophage activation and severity of an autoimmune disease (англ.) // Nature : journal. — 2002. — January (vol. 415, no. 6871). — P. 536—541. — doi:10.1038/415536a. — PMID 11823861.
6. ↑ Entrez Gene: HAVCR2 hepatitis A virus cellular receptor 2  (неопр.).
7. ↑ Hastings W. D., Anderson D. E., Kassam N., Koguchi K., Greenfield E. A., Kent S. C., Zheng X. X., Strom T. B., Hafler D. A., Kuchroo V. K. TIM-3 is expressed on activated human CD4+ T cells and regulates Th1 and Th17 cytokines (англ.) // European Journal of Immunology^[англ.] : journal. — 2009. — September (vol. 39, no. 9). — P. 2492—2501. — doi:10.1002/eji.200939274. — PMID 19676072. — PMC 2759376.
8. ↑ Gao X., Zhu Y., Li G., Huang H., Zhang G., Wang F., Sun J., Yang Q., Zhang X., Lu B. TIM-3 expression characterizes regulatory T cells in tumor tissues and is associated with lung cancer progression (англ.) // PLOS One : journal. — 2012. — Vol. 7, no. 2. — P. e30676. — doi:10.1371/journal.pone.0030676. — PMID 22363469. — PMC 3281852.
9. ↑ Gleason M. K., Lenvik T. R., McCullar V., Felices M., O'Brien M. S., Cooley S. A., Verneris M. R., Cichocki F., Holman C. J., Panoskaltsis-Mortari A., Niki T., Hirashima M., Blazar B. R., Miller J. S. Tim-3 is an inducible human natural killer cell receptor that enhances interferon gamma production in response to galectin-9 (англ.) // Blood^[англ.] : journal. — American Society of Hematology^[англ.], 2012. — March (vol. 119, no. 13). — P. 3064—3072. — doi:10.1182/blood-2011-06-360321. — PMID 22323453. — PMC 3321868.